孙燕院士发掘祖国的药物遗产，在肿瘤内科治疗方面特别提出中医药的“扶正固本”观念及治疗方法，取得了很大成就，应用“祛邪-扶正-强化治疗-扶正”的治疗模式，将我国淋巴瘤和小细胞肺癌综合治疗的治愈率，提升至国际先进水平。
孙燕院士研究发现，很多诸如灵芝孢子粉的传统中药，能帮助恢复人体免疫功能，抑制肿瘤病人T抑制（Ts）细胞的活性，保护肾上腺和骨髓功能，与放疗、化疗相配合，能有效改善患者的远期愈后。
——灵芝孢子粉治疗多种肿瘤的临床实证——
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